Project R-15236
Titel
Integratie van grofkorrelige moleculaire dynamica en fluorescentie-spectroscopie om ongeordendeeiwitcondensaten te ontrafelen (Onderzoek)
Abstract
Biomoleculaire condensaten zijn structuren die spontaan vormen via fasescheiding en hebben de
laaste jaren toenemende interesse aangetrokken. Ze zijn essentieel voor gezonde celwerking, maar
zijn ook betrokken bij ziekten. Dit project focust op het begrijpen van het condensatieproces van het
Tau-eiwit, dat onder andere geassocieerd is met de ziekte van Alzheimer. De fysisch-chemische
principes die de vorming van condensaten reguleren en de mechanismen die zich daarin voordoen,
zijn echter ongekend. Huidige experimentele technieken bieden slechts beperkte kwalitatieve
inzichten vanwege de complexe aard van condensaten. Om deze tekortkoming aan te pakken, zal ik
grofkorrelige moleculaire dynamica-simulaties gebruiken om condensaten te modelleren. Door in
vitro fluorescentiespectroscopie hiermee te integreren, beoog ik de computationele modellen te
verfijnen en hun realisme te waarborgen. Het nieuwe experiment-geleide computationele kader stelt
mij in staat om Tau en andere intrinsiek ongeordende eiwitten op verschillende niveaus te simuleren
en in silico-experimenten uit te voeren. Hierdoor zal ik uitgebreide inzichten verwerven in de
structuur en dynamiek van biomoleculaire condensatie en de eiwitten waaruit ze zijn opgebouwd.
Deze synergetische benadering zal onze kennis van biomoleculaire condensatiefenomenen en hun
implicaties bij Tau-gerelateerde pathologieën bevorderen, maar kan ook inspiratie bieden voor
synthetische biologie, geneesmiddelenontwikkeling en -ontdekking.
Periode
01 november 2024 - 31 oktober 2028